Eine hochrangige, internationale Auszeichnung gewann der Gütersloher Apothekergarten im Jahr 2018. Er wurde von der UN-Dekade Biologische Vielfalt ausgezeichnet. Dabei konnte der Apothekergarten die Fachjury überzeugen, einen vorbildlichen und bedeutsamen Beitrag für die Erhaltung der Biodiversität zu leisten und darüber hinaus einen nachhaltigen Nutzen zu haben. Die zahlreichen Arzneipflanzen tragen aktiv zur Erhaltung der Artenvielfalt bei und informieren die Besucher über deren Heilkräfte. Zudem wurde das Projekt auch aufgrund seiner innovativen Herangehensweise und langfristigen Auslegung ausgezeichnet.

Der Green Flag Award ist eine hohe gärtnerische Auszeichnung, die ihren Ursprung in England und Wales hat und für besonders gepflegte Park- und Gartenanlagen verliehen wird. Der Stadtpark Gütersloh gewann im Ensemble mit dem Botanischen Garten bereits zweimal (2012 und 2014). Dieses Qualitätssiegel adelt das Gütersloher Grün quasi wie ein Michelin-Stern die besten Restaurants. Die Voraussetzungen für den Green Flag Award sind hoch: Ein breit gefasster, strenger Kriterienkatalog beurteilt nicht nur Pflege und Sauberkeit, sondern auch Begehbarkeit, Behindertengerechtigkeit sowie ein erfolgreiches Parkmanagement mit gutem Marketing. Der Stadtpark und der Botanische Garten inklusive des Apothekergartens befinden sich mit dieser Auszeichnung in berühmter Gesellschaft: Auch an den Gärten der Welt in Berlin und den Wörlitzer Anlagen in Sachsen-Anhalt weht die begehrte grüne Flagge.

Seit dem Jahr 2000 steht der Stadtpark Gütersloh unter Denkmalschutz und ist Mitglied im Europäischen Gartennetzwerk. Beim Wettbewerb „Deutschlands schönster Park“ erreichte er 2006 den dritten Platz.